Après ce que Lloyd croit être la mort des ninjas et de Wu, la terreur règne sur Ninjago. Garmadon, désormais de retour, en devient l'Empereur. Harumi qui est le Silencieux, s'en réjouit. Quant à Lloyd, n'ayant plus ses pouvoirs et dévasté par la mort de ses amis, n'est plus très optimiste. Toute la ville est sous le contrôle de Garmadon et de son colosse. Les derniers résistants sont obligés de se cacher...