Après la saison 1, Loki se retrouve dans une bataille pour sauver le Tribunal des Variations Anachroniques. En compagnie de Mobius, du chasseur B-15 et d'une équipe de nouveaux personnages et de ceux qui reviennent, Loki navigue dans un multivers de plus en plus vaste et dangereux à la recherche de Sylvie, du juge Renslayer, de Miss Minutes et de la vérité sur ce que signifie posséder un libre arbitre et un but glorieux.